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{ Monthly Archives } December 2008

《结构方程模型及其应用》(侯, 温, & 成,2004)部分章节R代码

用John FOX教授的sem包试写了这本教材的几个例子,结果都与LISREL8报告的Minimum Fit Function Chi-Square吻合。不过LISREL其它拟合指标用的是Normal Theory Weighted Least Squares Chi-Square ,所以看上去比Minimum Fit Function Chi-Square报告的结果要好那么一些些。LISREL历史上推的GFI/AGFI曾因为经常将差报好被批评,圈内朋友私下嘲笑这样LISREL就更好卖了,买软件的用户也高兴将差报好,只有读Paper的人上当。
目前只写了chap3_1..到Chap3_2_...,一共5(或6)个例子。尺有所短,寸有所长--sem包不会自动报告所有修正指数,不能做样本量不一样多的多组模型,对复杂的模型要写的代码太多。不过,在已经尝试的几个例子里,有一个是LISREL跑不出来但sem包能跑出结果的。目前sem包还没有达到结构方程众多商业软件的成熟水准,但R庞大的义工武器库已经使sem包至少已经在Missing Data Multiple Imputation、Bootstrapping等等应用上胜出一筹。所以例子中还附带了缺失数据一讲Multiple Impuation的R示范代码。
欢迎各位有兴趣作类似尝试的同学将结果email我, 可以陆续更新到下面的GPL版权代码集合中。
代码下载:lixiaoxu.googlepages.com (中大镜像)
[update] AMos, Mplus 与 SAS/STAT CALIS 缺省报告与使用的都是 Minimum Fit Function Chi-Square,可通过各种软件(Albright & Park, 2009)的结果对比查验。Normal Theory Weighted Least Squares Chi-Square并非总是比Minimum Fit Function Chi-Square报告更“好”的拟合结果(虽然常常如此)。Olsson, Foss, 和 Breivik (2004) 用模拟数据对比了二者,确证Minimum Fit Function Chi-Square计算得到的拟合指标在小样本之外的情形都比Normal Theory Weighted Least Squares Chi-Square的指标更适用。
R的sem包目前在迭代初值的计算上还做得不够好。我遇到的几个缺省初值下迭代不收敛案例,将参数设定合理范围的任意初值(比如TX,TY都设成0-1之间的正实数)之后都收敛了。
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Albright, J. J., [...]

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Paper for 1st Chinese useR! Conference: Web Powered by R, or R Powered by Web

欢迎在本部的同学明天上午到现场看李崇亮同学演示,地点见会议主页
论文下载(Googlepages, 中文大学镜像)
RWebFriend for Wordpress 在线示例(yo2.cn上的示例,  奇想录上的临时示例)
Google Presentation 在线演示

[update2009.07.11]文中MediaWiki与R集成的实验平台已不再开放编辑权限,原例转到另一个平台上(界面是西班牙语,找不到英语界面的平台)。希望能有帮手提供linux服务器自建一个平台。

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Misunderstanding of Eq. 4 in Singer’s (1998) SAS PROC MIXED paper

Singer (1998, p. 327, Eq. 4) gave a big covariance matrix as the following --
...if we combine the variance components for the two random effects together into a single matrix, we would find a highly structured block diagonal matrix. For example, if there were three students in each class, we would have:

If the number of [...]

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